Vsebina
Proteine tvorimo iz polimernih ali amino kislinskih verig. Zaporedje aminokislin (skupaj s kakršnimi koli spremembami) določa, katero beljakovinsko strukturo bo sprejelo. Proteini imajo štiri strukturne ravni: primarno, sekundarno, terciarno in kvartarno. Primarna struktura je samo aminokislinsko zaporedje, medtem ko se sekundarna struktura nanaša na 3-D strukturo, ki jo sprejmejo segmenti aminokislinske verige.
Alfa vijačnica
Alfa heliks je zelo pogost tip sekundarne strukture, v kateri se veriga aminokislin spremeni v občutljivo tuljavo. Dušik petidne vezi v vsaki aminokislini ima z njim vezan vodik, tako da lahko tvori vrsto interakcije, imenovano vodikova vez, z atomom kisika karbonilne skupine vsake vezi. Vodikove vezi skupaj držijo propeler in pomagajo ohraniti njegovo obliko.
Stranske verige
Vse aminokislinske stranske verige alfa heliksa kažejo navzven, kar naredi celotno zanko vsakih 3.6 aminokislin. Propeler se zavrti v smeri urinega kazalca, zato ga včasih označimo kot "desno". Beljakovina lahko vsebuje več alfa helikov in nekatere beljakovine, kot je keratin (beljakovina v laseh in nohtih), imajo to vrsto strukture v večini njihove dolžine.
Beta listi
Ploščo beta držijo tudi vodikove vezi, toda v tem primeru sta dve regiji polipeptida nameščeni drug ob drugem in vodikove vezi jih držijo skupaj v nekakšni nagubani list papirja. Seznanjene žice se lahko vrtijo v nasprotnih smereh, v tem primeru so antiparalelne ali pa so vzporedne, pri čemer imata obe vrvici isto smer. Antiparalelna ureditev je pogostejša. Stranske verige aminokislin alternativno kažejo navzgor in navzdol, pravokotno na ravnino lista.
Premisleki
Polipeptidi lahko vključujejo več beta listov in dele alfa heliksa kot dele svoje celotne 3-D strukture ali terciarne strukture. Posamezen polipeptid je lahko protein sam ali pa se lahko veže za tvorbo proteina. Če gre za več polipeptidov, se njihova prostorska razporeditev imenuje kvarterna struktura. Sekundarna struktura se nanaša posebej na značilnosti alfa heliksa in beta plošče. Kot terciarne in kvartarne strukture lahko sekundarna struktura postane neurejena ali denaturirana z uporabo visokih temperatur in / ali pomembnih sprememb v pH.