Kako izračunati izoelektrično točko peptidov

Avtor: Robert White
Datum Ustvarjanja: 26 Avgust 2021
Datum Posodobitve: 13 November 2024
Anonim
Biokemija Računanje izoelektrične točke polipeptida
Video.: Biokemija Računanje izoelektrične točke polipeptida

Vsebina

Peptidi so fragmenti kratkih polimerov, sestavljenih iz aminokislin. Vsak peptid ima določeno zaporedje aminokislin, označeno s tričrkovno kodo ali samo eno; na primer aminokislina alanin je okrajšana kot "Ala" ali "A". Obremenitev peptidov v raztopini je odvisna od njene kislosti. Izoelektrična točka (pI) se nanaša na vrednost kislosti raztopine, v kateri ima molekula peptida neto naboj enak nič. Topnost peptida je na izoelektrični točki minimalna. Za izračun vrednosti pI za aminokislinsko zaporedje peptida uporabite razpoložljive spletne strežnike.

Korak 1

Zaporedite peptid z enočrkovno kodo. Če ima na primer peptid aminokislinsko zaporedje Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanin - Serin - Glutaminska kislina - Levcin - Prolin), bi bilo enočrkovno zaporedje "ASELP". Po potrebi glejte tabelo za pretvorbo v eno črko v tri črke v oddelku Viri.


2. korak

S katerim koli brskalnikom, na primer Internet Explorerjem ali Firefoxom, vnesite strežnik, ki izračuna izoelektrično točko peptida (pI); glej Viri.

3. korak

V polje vnesite enočrkovno zaporedje peptida - v našem primeru »ASELP« in kliknite »Compute«.

4. korak

Odčitajte vrednost izoelektrične točke (pI), podano v vrstici "Teoretični pI / Mw" (teoretični pl). V našem primeru je pI 4,00. Upoštevajte, da strežnik izračuna tudi molekulsko maso (Mw) peptida.